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基因组重测序
低深度重测序
低深度重测序
简要概述
全隐性基因遗传染色体基因遗传染色体组低深度1.重测序（Low coverage WGS，LcWGS）指的是回收利用较低深度1.（~1×）的重测序的数据分析源来隐性基因遗传染色体进化分析，在此之后借助隐性基因遗传染色体基因遗传染色体型注射，将低体积的数据分析源注射为高体积隐性基因遗传染色体基因遗传染色体型的数据分析源。LcWGS 不需要系统软件制作，测序料工费低，可以修改全隐性基因遗传染色体基因遗传染色体组隐性基因遗传染色体进化，更有帮助于大规模样表的特性wifi定位及 GS 选育选用。
应用场景
01. 性状定位
动植物全基因组关联分析
02. 遗传评估
动植物全基因组选择育种
技术优势
  • 变异信息
    丰富
    可赢得全什么是基因组的基因突变
  • 高性价比
    以太低的测序人工成本可控，赢得密度高的计算的标示，检测工具转化率高
  • 大群体
    样本检测
    适用性于大受众的染色体型查测及理论研究
  • 分型
    准确性高
    因为充填计算方式，分几型精确率高达98%
技术流程
优秀案例
低深度重测序--猪胴体分割性状及形态性状的遗传解析与基因组预测
本研究测定了长白、大白、长大二元以及杜长大三元猪4个群体的2,012头猪的17个分割肉性状和14个胴体性状。使用单倍型GWAS分析和基于基因型填充数据的GWAS分析分别鉴定到14个和112个与胴体分割性状极显著相关的QTLs。利用“中芯一号”芯片检测数据和基因型填充数据对这四个不同群体的分割肉性状和胴体性状进行全基因组选择研究。比较不同基因型数据、不同群体、以及不同预测模型对基因组预测准确性的影响。
图1 GWAS遗传性状手机定位及GS最终会比较
参考文献
Xie, L., Qin, J., Rao, L., Cui, D., Tang, X., Chen, L., Xiao, S., Zhang, Z., & Huang, L. (2023). Genetic dissection and genomic prediction for pork cuts and carcass morphology traits in pig. Journal of animal science and biotechnology, 14(1), 116.
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