星空在线登录官网

种业服务
业务介绍
当前所在的位置:
乌鳢
乌鳢
产品介绍
中国人海产品业科学实验探究方案院珠江海产品业探究方案所赵建探究方案员项目团队与背景康普森林业科学十分有限集团公司联手研发好几回款符合于乌鳢的靶向药物获取制种集成电路集成ic ——“乌鳢50K制种集成电路集成ic”。该集成电路集成ic其中包含了50K个高高质量的SNPs位点,区域了与男女涉及到的用途位点,应中用乌鳢全DNA组的选择制种、产品種育出、团队家系倡导及系谱判定等框架探究方案。
产品设备企业信息 根本数据 乌鳢50K生物育种心片
记号的信息 标志类 SNP
标志总量 50000
年龄有关系位点 230
系统类行 康普森CAGT®靶点驯服测序枝术
测序客群 广东、广东、江西、江西、江苏、陕西、石家庄、辽宁等地域乌鳢还有白乌鳢、金乌鳢
考生人类基因组 GCA_033026475.1
应用方向
育种保种应用
全基因组选择育种
新品种培育
群体家系构建及系谱鉴定
基础研究
全基因组关联分析
选择信号分析
群体遗传进化分析
种质资源评估
数据表现
乌鳢50K育种芯片 — 染色体分布情况

图1 芯片位点在染色体上的分布图
乌鳢50K育种芯片 — MAF分布

图2 芯片位点MAF分布
乌鳢50K育种芯片 — 位点注释情况

图3 芯片位点注释情况

乌鳢50K育种芯片 — PCA比较分析

下图为根据群体原始基因型获得的PCA(左图),下图为根据芯片SNP位点获得的PCA(右图),样本聚集情况在二者中表现基本一致,说明该芯片可较好地代表群体原始状况。